ARTIKEL REVIEW: “MOLECULAR DOCKINGBERBAGAI JENIS TANAMAN SEBAGAI ANTIBAKTERITERHADAP TARGET ENZIM DNA GYRASE”
DOI:
https://doi.org/10.71417/galen.v2i1.92Keywords:
Antibakteri, Molekuler Docking, TanamanAbstract
Resistensi antibiotik merupakan masalah serius di bidang kesehatan karena
menurunkan efektivitas terapi dalam mengatasi infeksi bakteri. Oleh karena itu, pencarian
agen antibakteri baru dari bahan alam menjadi penting. Salah satu pendekatan yang
banyak digunakan adalah molekular docking, yang mampu memprediksi interaksi antara
senyawa aktif tanaman dengan protein target bakteri secara cepat, efisien, dan hemat
biaya. Artikel tinjauan ini merangkum hasil penelitian terkini mengenai potensi berbagai
tanaman seperti daun kelor (Moringa oleifera), kunyit putih (Curcuma zedoaria), bawang
putih (Allium sativum), jahe (Zingiber officinale), lempuyang (Zingiber aromaticum),
rosela (Hibiscus sabdariffa L.), jeruk nipis (Citrus aurantiifolia), kumis kucing
(Orthosiphon stamineus Benth), daun waru (Hibiscus tiliaceus), dan mangrove
(Rhizophora stylosa) sebagai antibakteri. Senyawa bioaktif seperti quercetin,
curcumenol, germacrone, alliin, gingerol, serta zerumbone dilaporkan memiliki afinitas
ikatan baik terhadap protein target bakteri, termasuk DNA gyrase, MurE, dan PBP2.
Beberapa senyawa bahkan menunjukkan nilai binding affinity mendekati atau lebih baik
dibandingkan antibiotik standar. Dengan demikian, molekular docking menggunakan
perangkat lunak seperti AutoDock dapat dijadikan tahap awal skrining kandidat obat
antibakteri alami. Pendekatan ini berpotensi mendukung pengembangan fitofarmaka
yang efektif dan aman dalam menghadapi resistensi antibiotik.
Downloads
References
Amin, S., & Nabila, L. S. (2025). Review Artikel : Peran Pendekatan In Silico Dalam
Kimia Medisinal. Indonsian Journal of Science, 1(6), 1345–1349.
Astari, S. M., Rialita, A., & Mahyarudin, M. (2021). Aktivitas Antibakteri Isolat Bakteri
Endofit Tanaman Kunyit (Curcuma longa L.) Terhadap Pertumbuhan
Staphylococcus aureus. Jurnal Fitofarmaka Indonesia, 8(2), 9–16.
https://doi.org/10.33096/jffi.v8i2.644
Dinda Nurhayati Famili, & Saeful Amin. (2025). Studi Docking in Silico Analisis Potensi
Jahe (Zingiber Officinale Roscoe) Sebagai Obat Pengganti Omeprazole Untuk Ibu
Hamil. Journal of Public Health Science, 2(2), 197–203.
https://doi.org/10.70248/jophs.v2i2.2220
Fatma, N. A., Fitria, F. N., Siswanto, H. M., Sofa, N., R., I. S., Sa’adah, R. F. N., Wijaya,
M. A. H., Fitriyah, F., & Saefi, M. (2025). ANALISIS SENYAWA AKTIF DAUN
WARU (Hibiscus tiliaceus) SEBAGAI ANTIBAKTERI TERHADAP Escherichia
coli. Biology Natural Resources Journal, 3(2), 93–99.
https://doi.org/10.55719/binar.v3i2.1557
Ferwadi, S., Rahmat, G., & Astuti, W. (2017). Molecular Docking Study of Cinnamate
Acid Compound and its Derivatives as Protein 1J4X Inhibitor to Cervical Cancer
Cell. Jurnal Kimia Mulawarman, 14(2), 84–90.
http://www.rcsb.org/pdb/explore/explore.do?
Hadi, I., Ulfah, M., Efriani, L., & Putra, T. A. (2023). STUDI IN SILICO DAN IN
VITRO: AKTIVITAS ANTIBAKTERI EKSTRAK ETANOLIK MANGROVE
(Rhizophora stylosa) DENGAN TARGET PERUSAKAN DINDING SEL
Escherichia coli. Medical Sains : Jurnal Ilmiah Kefarmasian, 8(2), 549–558.
https://doi.org/10.37874/ms.v8i2.617
Inayah, I., Hadisoebroto, G., & Aini, F. N. (2024). Studi In Silico Senyawa dari Herba
Sambiloto (Andrographis paniculata) terhadap Protein Dihydrofolate Reductase
(4KM2) pada Mycobacterium tuberculosis. Jurnal Sabdariffarma, 12(1), 32–50.
https://doi.org/10.53675/jsfar.v12i1.1317
Islamiyati, D., Husen, F., & Ina Ratnaningtyas, N. (2023). Potensi aktivitas antibakteri
ekstrak moringa oleifera (Lamk.) terhadap bakteri escherichia coli secara in silico
Tulis judul penelitian, contoh : Pengaruh Reward and Punishment Terhadap Kinerja Pegawai
14 Galen - Vol. 1 No. 2 Agustus 2025
dan in vitro. Jurnal Bina Cipta Husada: Jurnal Kesehatan Dan Science, 19(2), 80–
90.
Kristiananda, D., Allo, J. L., Widyarahma, V. A., Lusiana, L., Noverita, J. M., Octa
Riswanto, F. D., & Setyaningsih, D. (2022). AKTIVITAS BAWANG PUTIH
(Allium sativum L.) SEBAGAI AGEN ANTIBAKTERI. Jurnal Ilmu Farmasi Dan
Farmasi Klinik, 19(1), 46. https://doi.org/10.31942/jiffk.v19i1.6683
Kumar, V., Giamarellos-bourboulis, E. J., Martens, J. H. A., Rao, N. A., Aghajanirefah,
A., Manjeri, G. R., Li, Y., Daniela, C., Arts, R. J. W., Meer, B. M. J. W. Van Der,
Deen, P. M. T., Logie, C., Luke, A., Neill, O., Willems, P., Veerdonk, F. L. Van De,
& Meer, J. W. M. Van Der. (2014). mTOR/HIF1α-mediated aerobic glycolysis as
metabolic basis for trained immunity. Science, 345(6204), 1–18.
https://doi.org/10.1126/science.1250684.mTOR/HIF1
Marbun, E. D., Sapitri, A., & Arisetya, D. (2025). Formulasi dan Evaluasi Sediaan Obat
Kumur Dari Ekstrak Fermentasi Bawang Lanang (Allium sativum L.). Herbal
Medicine Journal, 8(1), 5–12.
Pinzi, L., & Rastelli, G. (2019). Molecular docking: Shifting paradigms in drug discovery.
International Journal of Molecular Sciences, 20(18).
https://doi.org/10.3390/ijms20184331
Putri, A. M. H., Dwi Mulyana, S., Aini, R. E. F. N., Syafi’in, N. P., Mahmudah, N. A. L.,
& Ats-Tsaqiifah, N. J. (2025). Studi In Silico Nanopartikel Perak dengan Jeruk Nipis
(Citrus aurantiifolia) sebagai Antibakteri. Jurnal Farmasi Tinctura, 6(2), 111–125.
https://doi.org/10.35316/tinctura.v6i2.7315
Rajalakshmi. D, & Narasimhan, S. (1985). Antioxidants: Sources and Methods of
Evaluation dalam D.L. Madhavi: Food Antioxidant, Technological, Toxilogical and
Health Perspectives. Marcel. MarcelDekker Inc., Hongkong, 5(1), 76–77.
Ramadhani, F. A., Prastika, M. F., Fikriyah, N., Isnaeni, & Diyah, N. W. (2024).
Molecular Docking of Flavonoids from Extract of Roselle (Hibiscus sabdariffa L.)
Calyx on PBP2a as the Basis for Antibacterial Activity Against Methicillin Resistant
Staphylococcus aureus. Science and Technology Indonesia, 9(2), 487–493.
https://doi.org/10.26554/sti.2024.9.2.487-493
Saeful Amin, & Tsani, G. A. (2025). Tinjauan Literatur: Molecular Docking Fitokimia
Indonesia Terhadap Target Terapeutik Empat Jenis Kanker. Journal of Public
Health Science, 2(2), 183–190. https://doi.org/10.70248/jophs.v2i2.2191
Suena, N. M. D. S., Suradnyana, I. G. M., & Juanita, R. A. (2021). Formulation and
Antioxidant Activity Test of Effervescent Granule from Extract Combination of
White Turmeric (Curcuma zedoaria) and Turmeric (Curcuma longa L.). Jurnal
Ilmiah Medicamento, 7(1), 27–31.
Suherman, A. W. U., Hernawati, D., & Putra, R. R. (2023). Analisis In Silico : Aktivitas
Senyawa Antibakteri dalam Zingiber aromaticum terhadap Salmonella typhi.
Bioscientist : Jurnal Ilmiah Biologi, 11(1), 620.
https://doi.org/10.33394/bioscientist.v11i1.7636
Sulihah, N. T., Baidowi, I. I., Firdaus, J., & Wulan, H. N. (2025). Uji Aktivitas
Antibakteri Senyawa Bawang Putih (Allium Sativum L.) secara In Silico Terhadap
Bakteri Streptococcus Pneumoniae. Community Medicine and Public Health of
Indonesia, 5(3), 315–323.
Tania, P. O. A., Listyawati, A. F., Soekanto, A., Simamora, D., & Purbowati, R. (2024).
Studi Invitro dan Insilico Efektivitas Antibakteri Kunyit Putih Terhadap Hambatan
Pertumbuhan Escherichia Coli. The Indonesian Journal of Infectious Diseases,
10(1), 47–67. https://doi.org/10.32667/ijid.v10i1.188
Untari, I. (2010). Bawang Putih Sebagai Obat Paling Mujarab Bagi Kesehatan. Gaster,
7(1), 547–554. https://www.jurnal.stikes-
aisyiyah.ac.id/index.php/gaster/article/view/59
Wahyuni, S., Bermawie, N., & Kristina, N. N. (2013). Morphological Characteristic,
Yield Potential, and Major Rhizome Constituent of Nine Accession Numbers of
Wild Ginger. Jurnal Littri, 19(3), 99–107.
Downloads
Published
Issue
Section
License
Copyright (c) 2026 Adilla Nurafdilla Solihah, Saeful Amin (Author)
This work is licensed under a Creative Commons Attribution-NonCommercial-ShareAlike 4.0 International License.
